Ein zentrales Anliegen ihrer Philosophie war für Jeanne Hersch die Verteidigung der Freiheit. Das Individuums sollte weder von totalitären Strömungen noch von technokratischen Gesellschaftsbildern eingeengt werden. Sie knüpfte dabei an existenzphilosophische Traditionen an, insbesondere an das Denken ihres Lehrers Karl Jaspers, dessen Idee der "Grenzsituationen" sie aufgriff, um die Verletzlichkeit und Würde des Menschen zu thematisieren.

Ähnlich wie für die Existenzphilosophen war Freiheit für Hersch kein abstrakter Begriff, sondern eine konkrete Bedingung menschlichen Daseins. In ihrem Hauptwerk L'illusion philosophique (1955) setzte sie sich kritisch mit ideologischen Verengungen auseinander, die das Denken von der gelebten Erfahrung entfremden. Dabei sollte Philosophie kein abgeschlossenes System liefern, sondern ein offener Dialog sein, geprägt von Verantwortung, Entscheidung und Offenheit gegenüber dem Anderen.